Il sistema delle aree protette della regione Calabria presenta un’estensione ragguardevole sul territorio, ed è costituito da Parchi nazionali e regionali, Riserve naturali statali, Riserve naturali regionali, Riserve naturali terrestri, Aree marine protette, Oasi di protezione della fauna, SIN e SIR, IBA, Zone umide, SIC e ZPS.
La vallata dello Stilaro è interessata dal Parco Naturale Regionale delle Serre, dai SIC Vallata dello Stilaro, Bosco di Stilo-Bosco Archiforo, Dune di Guardavalle. Nelle vicinanze di trovano le riserve naturali statali Cropani-Micone, Marchesale, e i SIC Lacina, Bosco di Santa Maria, Dune di Isca, e la riserva naturale Marchesale.
Complessivamente il sistema delle aree protette è fomata da:
Parchi nazionali (3): Parco nazionale del Pollino, Parco nazionale della Sila (o Parco Nazionale della Calabria), Parco nazionale dell’Aspromonte.
Parchi regionali e Parchi regionali marini (10): Parco regionale delle Serre, Parco regionale della Catena Costiera, Parco regionale della Sila Greca, Parco regionale dei Monti Roventino e Mancuso, Parco Marino Regionale "Riviera dei Cedri”, Parco Marino Regionale "Baia di Soverato", Parco Marino Regionale "Costa dei Gelsomini", Parco Marino Regionale "Scogli di Isca", Parco Marino Regionale "Fondali di Capocozzo S. Irene Vibo Marina Pizzo Capovaticano Tropea".
Aree marine protette (1): Area Marina protetta di Isola Capo Rizzato
Riserve naturali statali (47) :Coturelle-Piccione, Cropani-Micone, Gallopane, Gariglione-Pisarello, Gole del Raganello, Golia-Corvo, I giganti della Sila, Iona-Serra della Guardia, Macchia della Giumenta-San Salvatore, Marchesale, Poverella-Villaggio Mancuso, Serra Nicolino Piano d’Albero, Tasso Camigliatello Silano, Trenta Coste, Valle del Fiume Argentino, Valle del Fiume Lao, Giganti del Pesco, Bosco di Fallistro, Valle del Ferro, Foce del Neto, Scolacium, Lago Angitola, Valle del Satanasso, Lago di Tarsia e Foce di Crati, Bosco del Patire.
Riserva Naturale Regionale (2): Lago di Tarsia, Foce del Fiume Crati.
Oasi di protezione della Fauna (1) :Lago Angitola
Riserve Naturali Terrestri (28): Riserva Naturale Orientata dello Stato della Valle del Ferro comuni di Oriolo, Castroregio, Amendolara, Riserva Naturale Orientata della Stato della Valle del Satanasso comuni di Villapiana, Plataci, Cerchiara, Riserva Naturale Orientata dello Stato del Lago di Tarsia e della foce del Crati comuni di Tarsia, Sibari, e Corigliano, Riserva Naturale Orientata dello Stato del Bosco del Patire comuni di Corigliano e Rossano, Riserva Naturale Orientata dello Stato delle Gole del Raganello comune di S.Lorenzo di Bellizzi, Riserva Naturale Orientata dello Stato della Valle del Lao comune di Papasidero, Riserva Naturale Orientata dello Stato della Valle dell'Argentino comune di Orsomarso, Riserva Naturale Biogenetica dello Stato di Gallopane comune di Longobucco), Riserva Naturale Biogenetica dello Stato Golia Corvo comuni di Spezzano Sila e Celico, Riserva Naturale Biogenetica dello Stato del Tasso Camigliatello comuni di Spezzano Sila e Celico, Riserva Naturale Biogenetica dello Stato Iona Serra della Guardia comuni di Celico, Riserva Naturale Biogenetica dello Stato Macchia della Giumenta comuni di Longobucco e Bocchigliero, Riserva Naturale Biogenetica dello Stato del Bosco di Fallistro comune di Spezzano Sila, Riserva Naturale Orientata dello Stato Trenta Coste comune di Mongrassano, Riserva Naturale Biogenetica dello Stato Poverella Villaggio Mancuso comune di Taverna, Riserva Naturale Biogenetica dello Stato Coturelle Piccione comune di Alb, Riserva Naturale Biogenetica dello Stato Gariglione Pisarello comune di Taverna, Riserva Naturale Biogenetica dello Stato Cropani Micone, Riserva Naturale Biogenetica dello Stato Marchesale, Riserva Naturale Orientata dello Stato della foce del Neto, Riserva Naturale Orientata dello Stato di Scolacium,, Riserva Naturale dello Stato del Lago Angitola.
SIN - Siti di Importanza Nazionale (20): Munciarra–Timpone Cineco, Vallone San Tommaso, Monte Basilicò, Bosco Luta, Vallone del Vitravo, Stagno c/o Capo Rizzuto, Torrente Pesipe, Fiumara San Leo, Serro Priolo, Torrente Rondone, Contrada San Nicola, Torrente Calivi, Torrente Abbrusciato, Monte Cerasia, Vallone Cendri, Capo Bruzzano, Torrente Aposcipo, Vallone Colella, Alta Valle Fiumara Sciarapotamo, Torre di Taureana.
SIR - Siti di Importanza Regionale (7): Contrada Luporini, Stagni di Lagarò, Sugherete di Fiumefreddo, Sugherete di Squillace, Torrente Pisano, Portella di Bova, Vallone Galatrella.
IBA (6): Alto Jonio Casentino (prima denominata Valle del Ferro), Sila Grande, Marchesato e Fiume Neto, Costa Viola, Aspromonte. Le IBA “Monti dell’Orsomano, Verbicaro” e “Pollino” sono state unite nell’IBA “Pollino-Orsomano”.
Zone umide (1): Bacino dell'Angitola.
Siti di interesse comunitario (179): Timpone della Capanna, Serra del Prete, Pollinello-Dolcedorme, Rupi del Monte Pollino, Cima del Monte Pollino, Cima del Monte Dolcedorme, Valle Piana-Valle Cupa, La Petrosa, Timpone di Porace, Stagno di Timpone di Porace, Pozze Boccatore/Bellizzi, Timpa di S.Lorenzo, Serra delle Ciavole-Serra di Crispo, Fagosa-Timpa dell'Orso, Il Lago (nella Fagosa), Pozze di Serra Scorsillo, Gole del Raganello, Monte Sparviere, Fonte Cardillo, Cozzo del Pellegrino, Piano di Marco, Valle del Fiume Argentino, Valle del Fiume Lao, Fiume Rosa, Valle del Fiume Abatemarco, La Montea, Monte La Caccia, Valle del Fiume Esaro, Serrapodolo, Fondali di Capo Tirone, Isola di Dino, Fondali Isola di Dino-Capo Scalea, Fondali Isola di Cirella-Diamante, Isola di Cirella, Scogliera dei Rizzi, Fondali Scogli di Isca, Montegiordano Marina, Pinete di Montegiordano, Fiumara Saraceno, Fiumara Avena, Foce del Fiume Crati, Macchia della Bura, Fiumara Trionto, Fondali Crosia-Pietrapaola-Cariati, Farnito di Corigliano Calabro, Dune di Camigliano, Casoni di Sibari, Secca di Amendolara, Torrente Celati, Lago di Tarsia, Bosco di Mavigliano, Orto Botanico - Università della Calabria, Pantano della Giumenta, Crello, Laghi di Fagnano, Laghicello, Monte Caloria, Foresta di Cinquemiglia, Monte Cocuzzo, Foresta di Serra Nicolino-Piano d'Albero, Varconcello di Mongrassano, Foreste Rossanesi, Vallone S. Elia, Bosco di Gallopane, Vallone Freddo, Palude del Lago Ariamacina, Macchia Sacra, Timpone della Carcara, Monte Curcio, Pineta di Camigliatello, Acqua di Faggio, Cozzo del Principe, Bosco Fallistro, Arnocampo, S. Salvatore, Pineta del Cupone, Pianori di Macchialonga, Serra Stella, Juri Vetere Soprano, Nocelleto, Carlomagno, Stagni sotto Timpone S. Francesco, Pescaldo, Foce Neto, Fondali di Gabella Grande, Fondali da Crotone a Le Castella, Dune di Marinella, Capo Colonne, Dune di Sovereto, Capo Rizzuto, Colline di Crotone, Foce del Crocchio-Cropani, Monte Fuscaldo, Timpa di Cassiano- Belvedere, Murgie di Strongoli, Monte Femminamorta, Fiume Lese, Fiume Lepre, Fiume Tacina, Fondali di Staletti, Lago La Vota, Palude di Imbutillo, Dune dell'Angitola, Oasi di Scolacium, Steccato di Cutro e Costa del Turchese, Dune di Isca, Dune di Guardavalle, Madama Lucrezia, Boschi di Decollatura, Monte Gariglione, Colle Poverella, Pinete del Roncino, Monte Contrò, Torrente Soleo, Colle del Telegrafo, Scogliera di Staletti, Lago dell'Angitola, Fiumara di Brattirò (Valle Rufa), Zona costiera fra Briatico e Nicotera, Fondali di Pizzo Calabro, Fondali di Capo Vaticano, Fondali Capo Cozzo - S. Irene, Bosco Santa Maria, Marchesale, Lacina, Bosco di Stilo - Bosco Archiforo, Pentidattilo, Fiumara di Melito, Monte Basilicò -Torrente Listi, Canolo Nuovo, Zomaro, Zillastro, Vallata del Novito e Monte Mutolo, Vallata dello Stilaro, Prateria, Calanchi di Maro Simone, Collina di Pentimele, Capo dell'Armi, Capo S. Giovanni, Capo Spartivento, Saline Joniche, Calanchi di Palizzi Marina, Fiumara Amendolea (incluso Roghudi, Chorio e Rota Greco), Fiumara Buonamico, Fiumara Laverde, Fiumara di Palizzi, Sant'Andrea, Contrada Gornelle, Pantano Flumentari, Piani di Zervò, Monte Fistocchio e Monte Scorda, Torrente Menta, Montalto, Vallone Cerasella, Torrente Ferraina, Costa Viola e Monte S. Elia, Bosco di Rudina, Spiaggia di Brancaleone, Torrente Lago, Torrente S. Giuseppe, Pietra Cappa - Pietra Lunga - Pietra Castello, Torrente Vasi, Torrente Portello, Vallone Fusolano (Cinquefrondi), Valle Moio (Delianova), Fosso Cavaliere (Cittanova), Contrada Fossia (Maropati), Scala-Lemmeni, Spiaggia di Pilati, Fondali da Punta Pezzo a Capo dell'Armi, Fondali di Scilla, Monte Tre Pizzi, Piano Abbruschiato, Monte Campanaro, Monte Scrisi, Serro d'Ustra e Fiumara Butrano, Alica, Contrada Scala, Monte Embrisi e Monte Torrione, Fiumara Careri, Spiaggia di Catona.
Zone di protezione speciale (6): Parco Nazionale della Calabria, Sila Grande, Pollino e Orsomarso, Alto Ionio Cosentino, Marchesato e Fiume Neto, Costa Viola.
Oasi Legambiente (2): Oasi naturalistica del Lago di Ariamacina, Il Fortino.
Oasi WWF (2): Lago dell'Angitola, Scogli di Isca